氣體質譜分析儀是利用離子阱作為分析器的質譜儀，由一個雙曲面截面的環形電極和上下一對端電極構成。

　　氣體質譜分析儀功能：

　　1、可升級的電子轉移裂解模塊可以提供傳統裂解方法無法得到的蛋白質翻譯后修飾信息。

　　2、脈沖碰撞能量誘導解離功能可以提供低質量端碎片離子信息。

　　3、高選擇MS/MS分析給譜圖在數據庫和譜庫檢索更好的匹配，提高了結構確證的可靠性。另外快速極性切換，母離子相關MS3數據關聯掃描，可以對翻譯后修飾和代謝物組成的鑒定進行智能、快速分析，還可以和的回旋共振質譜組合成的多級高分辨雜交質譜儀。

　　4、自動數據依賴性多級質譜采集技術不僅為用戶提供預測代謝物結構信息，也能提供未預測到的代謝物結構信息。此外使用自動固定中性丟失數據依賴性掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。

　　在使用氣體質譜分析儀前請確認并檢查以下條件:

　　1.常規ESI源已安裝完畢。

　　2.儀器已經正確安裝并且經過廠商工程師的檢測。

　　3.質譜儀屬于精密貴重儀器,未經專門培訓人員不得擅自開啟使用,更不得隨意“調校”氮氣和氦氣壓力或更改儀器參數等。

　　4.檢查液氮罐和氦氣鋼瓶是否有一定壓力,以便為測試樣品提供符合流速和壓力要求的氮氣和氦氣。

　　5.氣體質譜分析儀樣品溶液必須澄清透明,不含有固體微粒,不得將粗提物直接用于測定，以免堵塞噴霧針或者污染毛細管。測試用的液相溶劑體系不得含有不揮發性的酸、堿、鹽。